Azərbaycanın ali məktəblərində üçpilləli təhsil tətbiq ediləndən bəri, yəni 1997-ci ildən etibarən Bakı Musiqi Akademiyasında magistr hazırlığı aparılır. BMA magistraturasında ödənişli və ödənişsiz təhsil almaq olar; burada təhsilin yalnız əyani forması mövcuddur.
BMA magistraturasında təhsil kredit sistemi üzrə aparılır.
Hazırda BMA magistraturasında iki istiqamət üzrə təhsil almaq olar: 1) nəzəri yönümlü magistratura və 2) ixtisas magistraturası.
Nəzəri istiqamətdə təhsil əsas etibarilə 060307-“Musiqişünaslıq” ixtisası üzrə aparılır. Burada təhsil müddəti 2 ildir; magistrantlar təhsil müddətində 120 kredit toplamalıdırlar; magistraturanı bitirərkən tələbələr magistrlik dissertasiyası müdafiə edir və “magistr” dərəcəsi alırlar. Bu ixtisas üzrə BMA magistraturasına daxil olanlar iki mərhələdə qəbul imtahanları verirlər. Dövlət İmtahan Mərkəzi tərəfindən aparılan qəbul imtahanları test üsulu ilə keçirilir. Birinci mərhələdə tələbələr ümumi humanitar fənlər (məntiq, xarici dil, informatika) üzrə test imtahanı verirlər; ikinci mərhələdə isə ixtisas fənləri (musiqi tarixi, polifoniya, musiqi təhlili, Azərbaycan xalq musiqi yaradıcılığı, Aəzrbaycan xalq musiqisinin əsasları) üzrə test imtahanı verirlər. Bu imtahanların nəticələri müəyyən edildikdən sonra tələbələr ümumi müsabiqə yolu ilə ödənişsiz və ödənişli yerlərə yerləşdirilirlər.
2017-ci ildən başlayaraq BMA-da ixtisas magistraturası üzrə təhsil aparılır. İxtisas magistraturasına qəbul iki mərhələdə keçir: 1-ci mərhələ test imtahanları, 2-ci mərhələ ixtisas fənnindən qəbul imtahanından ibarətdir. Bu istiqamətdə təhsil müddəti 1,5 ildir; magistrantlar təhsil müddətində 90 kredit toplamalıdırlar; tələbələr magistraturanı magistrlik yekun yaradıcılıq işi ilə bitirirlər.
Bu istiqamətdə təhsil aşağıdakı ixtisaslar üzrə aparılır:
060303 - İnstrumental ifaçılıq (sahələr üzrə)
İxtisaslaşmalar:
fortepiano, orqan, klavesin;
orkestr alətləri: simli,nəfəs və zərb alətləri
060304 - Solo oxuma (sahələr üzrə)
İxtisaslaşma:
akademik vokal
060305 - Dirijorluq (növlər üzrə)
İxtisaslaşma:
xor dirijorluğu
opera-simfonik dirijorluğu
nəfəs alətləri orkestrinin dirijorluğu
060306 - Bəstəkarlıq